Los valores sobre los cuales el Instituto de Investigaciones Históricas desarrolla sus tareas son: el rigor científico, la honestidad intelectual, el compromiso con la verdad, el servicio a la comunidad.

El Instituto de Investigaciones Históricas es una dependencia universitaria que tiene como misión: 

a) Realizar investigación en el campo de la Historia y las Ciencias Sociales que permita ampliar y renovar el conocimiento de la historia de Michoacán, de México y de América.

b) Desarrollar labores de docencia al nivel de posgrado y contribuir a la formación de profesionales.

c) Organizar actividades de carácter académico que difundan y promuevan la investigación y la docencia.

d) Promover la publicación de obras que fortalezcan la memoria histórica y el rescate de nuestras raíces culturales. 

e) Contribuir en el rescate y conservación del patrimonio histórico y cultural de nuestro país.

f) Prestar asesoría, servicios técnicos y científicos en el campo de la Historia y las Ciencias Sociales, mediante la firma de convenios específicos, a particulares e instituciones públicas y privadas.

La visión del Instituto de Investigaciones Históricas es constituirse en una dependencia de excelencia académica, capaz de generar conocimientos originales, de formar recursos humanos de alto nivel y de desarrollar una importante labor de difusión y extensión, de tal manera que obtenga por ello reconocimiento al nivel nacional e internacional y sea un polo de atracción para estudiantes de posgrado y profesores de México, América Latina, Norteamérica y Europa.